Percorso Formativo Avanzato per l’Healthcare 5.0: Dalle Scienze Omiche all’Integrazione Digitale
Corso HPC - High Performance Computing
ll corso è articolato in 3 moduli, il primo modulo destinato a tutti, con una introduzione di carattere generale all'HPC, la seconda un po' più specifica per i ricercatori con conoscenze di base di programmazione, la terza dedicata al processing di dati omici utilizzando il calcolo ad alte prestazioni.
Destinatari: Ricercatori del progetto D34Health
Durata: 3 moduli
Modalità: Online tramite piattaforma UnitelmaSapienza
Modulo 1 - Introduction to HPC
Overview of high-performance computing (HPC). Introduction to infrastructure and resources available at CINECA for D34H researchers. Hands-on session covering Linux command-line basics, software module environments, and SLURM for job scheduling and execution.
Docente: Balasubramanian Chandramouli
Modulo 2 - Machine Learning & Deep Learning on HPC
Running Jupyter notebooks in HPC environments; GPU-accelerated computing with Python (e.g., CuPy, RAPIDS); introduction to machine learning and deep learning using real-world life science examples; distributed training with PyTorch across multiple nodes and GPUs
Docente: Juan Mata Naranjo
Modulo 3 - Bioinformatics & Workflow Management
Introduction to Parabricks, a GPU-accelerated toolkit for high-throughput genomics analysis, and Snakemake, a workflow management system that enables scalable and reproducible pipelines on HPC clusters.
Docente: Silvia Gioiosa
Referente Scientifico: dott.ssa Elisa Rossi
Fondazione D34Health
Mail: fondazione@d34health.it
Web: https://d34health.it/formazione/